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  • 微生物重测序

    产品介绍常见问题经典案例结果展示


    一站式解析变异与差异

    微生物种类繁多,菌株的分化速度快,需要有一个经济快速的方法,
    对大范围内的海量菌株进行测序研究,了解菌株间的变异信息。
    微生物基因组的重测序,是基于小片段文库的高通量测序数据,与近缘参考基因组进行比对,进行变异检测的方法。
    检测获得菌株和参考基因组的SNP、InDel、SV等变异信息,以精准快捷为特点,
    系统全面的检测变异信息。同时还可进一步进行物种进化、种群特征、选择压力等研究。

    精准、快捷、多样化重测序方案

    微生物重测序产品,以精准快捷为核心,切中核心目标,
    准确检测菌株间的重要变异信息。

    产品 测序平台 测序策略 检测内容 项目周期
    细菌重测序 Illumina PE150 350 bp文库 ≥ 100 X SNP、InDel、SV 30个自然日
    真菌重测序 Illumina PE150 350 bp文库 ≥ 30 X SNP、InDel、SV、CNV 30个自然日

    科学方案设计

    从材料选取,建库测序,到数据分析,
    每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

    信息分析

    分析内容=标准分析+高级分析。
    深入到位的数据分析可系统、全面了解样本的信息。变异检测只是重
    测序的数据基础,基于数据的挖掘,才是解释生物学问题的桥梁。一
    系列的信息分析,帮助我们更好的解读数据,了解菌株进化、选择和
    传播等重要问题。

    分析内容 解决问题
    变异检测 准确定位变异位点
    基本进化分析 构建系统进化树
    确定菌株间进化关系
    地域归属分析 研究菌株的地域传播规律
    分歧时间估计 讨论菌株支系之间的分化历史
    选择压力分析 菌株进化过程中的选择压力
    揭示与环境相关的关键基因
    变异基因功能富集 统计变异基因分布规律
    寻找变异丰富的功能分类

    悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

    微生物基因组重测序采用先进的Illumina测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
    诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
    实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
    以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

    出色完成每一个项目环节

    诺禾致源微生物合作遍布全球,截止2019年6月,微生物重测序结题样品数达上万个,
    项目合作领域涵盖了致病菌、益生菌、食用菌、药用菌株、工业菌株等广泛领域。
    “科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”
    确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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