RNA甲基化免疫共沉淀 (Methylated RNA Immunoprecipitation,MeRIP)基于 m6A 特异性抗体识别并结合 mRNA 上 m6A 的原理,以 RNA 免疫共沉淀方法富集甲基化修饰片段为基础,并联合高通量测序,研究发生 m6A 甲基化修饰的 mRNA 区域。
RNA 修饰能够在转录后水平上调控 RNA 的稳定性、定位、运输、剪切和翻译,因此 MeRIP 有助于在癌症发生和转移、胚胎发育、脂类代谢、环状 RNA 翻译和 DNA 损伤修复等生物学功能和作用机制方面的研究。具有“全面、高效、性价比高”的优势,已广泛应用于人、大鼠、小鼠、猪、拟南芥等物种的研究。
从材料选取,建库测序,到数据分析,每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。
诺禾致源 MeRIP 测序项目对
IP 实验合格的 RNA 样本建库
测序,获得高质量 reads,通
过 motif 分析判断 IP 的特异
性以及分析的可信性,高效预
测相关基因,进行功能富集分
析,构建m6A修饰图谱。
MeRIP-seq | 分析内容 | 解决问题 |
标准分析 | 测序数据质量评估 | 过滤掉低质量数据,保证数据质量 |
参考序列比对分析 | 唯一比对的 reads 分布统计 | |
Peak calling | 检出发生 m6A 修饰的可信区域 | |
Motif 分析 | 蛋白结合序列的偏好性 | |
Peak 峰相关基因注释 | Peak 在基因组及转录本 功能区上的分布 |
|
差异 peak 分析 | 分析不同样本间差异 peak 峰 | |
相关基因功能分析 | Peak 相关基因 GO, KEGG 富集分析 |
|
个性化分析、多组学关联分析需联系产品经理进行评估。 |
MeRIP 测序采用先进的 Illumina 测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用 DELL 计算节点和 Isilon 存储的高效组合,实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,以保证高效的数据处理和安全的数据存储。
诺禾致源已经成功完成对人、猪,拟南芥等物种进行 MeRIP 测序分析,助力客户在 Hepatology 等权威杂志发表多篇高水平文章?!翱蒲У姆桨干杓?,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”,确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。