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  • 16S、18S、ITS等扩增子测序

    产品介绍常见问题经典案例结果展示


    16S、18S、ITS等扩增子测序

    产品介绍常见问题经典案例结果展示


    一步到位检测环境微生物多样性

    扩增子测序是对特定长度的PCR产物或捕获的片段进行测序,分析序列中的变异。
    16S/18S/ITS等扩增子测序即通过提取环境样品的DNA,选择合适的通用引物扩增16S/18S/ITS的目标区域,
    通过检测目标区域的序列变异和丰度,以研究环境微生物多样性及群落组成差异。
    16S/18S rDNA为编码原/真核生物核糖体小亚基rRNA的DNA序列。
    ITS分为两个区域:ITS1位于真核生物rDNA序列18S和5.8S之间,ITS2位于5.8S和28S之间。

    读长长, 周期短, 性价比高。

    采用 Ion S5 XL 测序平台和 NovaSeq 6000 测序平台。NovaSeq 6000 测序平台通量更高,速度更快,运行时间更短,周期最短可达10天。Ion S5 XL测序平台单端测序,无需拼接,SE400/SE600 两种模式。两种平台,为扩增子测序提供更多的选择。

    科学方案设计

    从材料选取,建库测序,到数据分析,
    每一步都需要科学、缜密的设计,以保障高质量研究成果。

    信息分析

    分析内容=标准分析+高级分析。
    基于目标区域的测序,检测序列丰度,以充分研究环境微生物多样性和
    群落结构差异性。

    高级分析 解决问题
    肠型分析 肠道菌准确定位和疾病预测和治疗
    贝叶斯网络图 判断微生物之间、微生物和环境、
    代谢物间的依赖关系
    Source Tracker 样本中微生物群落来源
    标准分析 解决问题
    物种注释 物种注释及各物种丰度信息
    α-多样性分析 微生物群落的丰富度和多样性
    β-多样性分析 不同样本间的微生物群落
    及各样本差异情况
    多元统计分析 寻找组间具有显著差异的物种,
    同时可以比较组内差异和组间差异
    的大小,判断分组是否有意义
    CCA分析 研究物种组成与环境因子间的关系
    环境因子关联分析
    VPA分析
    功能预测 预测样本的功能组成

    扩增子测序解密环境微生物多样性

    诺禾致源基于多样性的测序区域选择,结合研究目的和样品自身的特点,
    灵活制定研究方案,用专业成熟的样本
    制备、建库以及数据分析流程,客观还原样品本身的菌群结构以及丰度。

    悦读高质量测序数据,尽享HPC澎湃动力

    扩增子测序采用先进的Ion S5 XL测序平台和NovaSeq 6000测序平台,快速、高效地读取高质量的测序数据。
    诺禾致源高性能计算平台(High Performance Computing,HPC)采用DELL计算节点和Isilon存储的高效组合,
    实现快速稳定的测序数据分析及交付。随着公司业务的发展,高性能计算平台将会持续更新并扩容,
    以保证高效的数据处理和安全的数据存储。

    项目经验丰富

    至2017年12月,诺禾致源诺禾16S样本数突破220,000例,
    包括土壤、水体、粪便、淤泥、发酵物等样本。
    “科学的方案设计,严格的质控管理,专业的分析团队,丰富的项目经验,优质的项目服务”
    确保每一个环节都能出色完成,助力科学研究。

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